有馬溫泉最大的特色在於擁有被稱為「金泉」和「銀泉」的2種泉質。金泉和銀泉各自具有不同的功效,泡哪一種溫泉也會對身體產生不同的效果。「金泉」含有有馬溫泉古來的鐵分和鹽分,具有促進血液循環的作用,對於患有冷症、腰痛、關節炎等症狀有著良好的療效。此外,鹽分還能在皮膚表面形成薄膜,增強保濕效果。有馬溫泉還具有殺菌作用,對於感染性皮膚病、慢性濕疹、荨麻疹等症狀也有療效。而「銀泉」的作用則是通過毛細血管擴張促進血流增加,對高血壓、末梢動脈閉塞性疾病、功能性動脈循環障礙等症狀有著良好的療效。由於金泉和銀泉具有不同的功效,建議選擇適合自己需要的泉質泡溫泉。